Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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MARCH6O60337 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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MARCH6O60337 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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MARCH6O60337 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MARCH6O60337 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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