Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VEGFDO43915 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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VEGFDO43915 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VEGFDO43915 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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