Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SYNGR3O43761 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms