Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBFA2T2O43439 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBFA2T2O43439 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms