Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF3O43395 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF3O43395 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms