Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FANCAO15360 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCAO15360 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCAO15360 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FANCAO15360 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FANCAO15360 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms