Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SETD1AO15047 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SETD1AO15047 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms