Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
IFIT3O14879 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IFIT3O14879 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms