Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BCKDKO14874 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms