Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTDSP2O14595 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTDSP2O14595 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms