Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C6orf229H3BNL8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C6orf229H3BNL8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms