Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NEDD8-MDP1E9PL57 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms