Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB5A8MRT5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB5A8MRT5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms