Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SRRM4A7MD48 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SRRM4A7MD48 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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