Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSC5DA1L4H1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms