Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
BIVM-ERCC5R4GMW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
BIVM-ERCC5R4GMW8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.5
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.1■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.09■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC42.95■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC42.92■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
BIVM-ERCC5R4GMW8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms