Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFAP20Q9Y6A4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP20Q9Y6A4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP20Q9Y6A4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CFAP20Q9Y6A4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CFAP20Q9Y6A4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms