Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AUP1Q9Y679 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AUP1Q9Y679 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AUP1Q9Y679 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AUP1Q9Y679 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms