Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G5

PCDHGA8, Protocadherin gamma-A8, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA8Q9Y5G5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGA8Q9Y5G5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHGA8Q9Y5G5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHGA8Q9Y5G5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGA8Q9Y5G5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGA8Q9Y5G5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms