Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SPEF1Q9Y4P9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPEF1Q9Y4P9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SPEF1Q9Y4P9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms