Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC49.92■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC49.92■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.9■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC49.9■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.89■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.89■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
DCAF1Q9Y4B6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC49.87■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC49.86■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC49.85■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC49.85■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC49.84■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC49.83■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.83■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC49.82■■■■■ 5.57
DCAF1Q9Y4B6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.81■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC49.81■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC49.79■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.78■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC49.77■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.76■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.76■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC49.75■■■■■ 5.56
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC49.75■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.74■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.74■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC49.74■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC49.73■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.72■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC49.72■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.7■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.7■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC49.7■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC49.69■■■■■ 5.55
DCAF1Q9Y4B6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC49.66■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.66■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC49.66■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.65■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC49.6■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC49.58■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.57■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC49.57■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC49.57■■■■■ 5.53
DCAF1Q9Y4B6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.56■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC49.56■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC49.52■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
DCAF1Q9Y4B6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC49.5■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC49.49■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC49.45■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.45■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.51
DCAF1Q9Y4B6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC49.44■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.44■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC49.43■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC49.42■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC49.42■■■■■ 5.5
DCAF1Q9Y4B6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC49.41■■■■■ 5.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms