Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPA5

BSN, Protein bassoon, humanhuman

Predictions only

Length 3,926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSNQ9UPA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BSNQ9UPA5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
BSNQ9UPA5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
BSNQ9UPA5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BSNQ9UPA5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
BSNQ9UPA5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSNQ9UPA5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BSNQ9UPA5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms