Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PADI4Q9UM07 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PADI4Q9UM07 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PADI4Q9UM07 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PADI4Q9UM07 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PADI4Q9UM07 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms