Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CPA4Q9UI42 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CPA4Q9UI42 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CPA4Q9UI42 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CPA4Q9UI42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPA4Q9UI42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPA4Q9UI42 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CPA4Q9UI42 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CPA4Q9UI42 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms