Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGJ1

TUBGCP4, Gamma-tubulin complex component 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP4Q9UGJ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TUBGCP4Q9UGJ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TUBGCP4Q9UGJ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TUBGCP4Q9UGJ1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TUBGCP4Q9UGJ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms