Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GABBR1Q9UBS5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GABBR1Q9UBS5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GABBR1Q9UBS5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GABBR1Q9UBS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms