Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CHMP5Q9NZZ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CHMP5Q9NZZ3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CHMP5Q9NZZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CHMP5Q9NZZ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CHMP5Q9NZZ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CHMP5Q9NZZ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms