Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
ARHGEF12Q9NZN5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
ARHGEF12Q9NZN5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
ARHGEF12Q9NZN5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
ARHGEF12Q9NZN5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
ARHGEF12Q9NZN5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
ARHGEF12Q9NZN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF12Q9NZN5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms