Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
MYOFQ9NZM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MYOFQ9NZM1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYOFQ9NZM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MYOFQ9NZM1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MYOFQ9NZM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms