Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-209ENST00000519627 697 ntTSL 26.17□□□□□ -1.426e-8■■■■■ 34.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 34.1
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3E-212ENST00000521614 1990 ntTSL 22.67□□□□□ -1.986e-8■■■■■ 34.1
IGF2BP1Q9NZI8 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 57.79□□□□□ -1.164e-23■■■■■ 34
IGF2BP1Q9NZI8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.184e-10■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 PRR11-203ENST00000578542 2334 ntTSL 512.03□□□□□ -0.486e-12■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 PRR11-209ENST00000614081 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.746e-12■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 PRR11-205ENST00000580177 1641 ntTSL 1 (best)9.31□□□□□ -0.926e-12■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 PRR11-201ENST00000262293 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.996e-12■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 PRR11-204ENST00000578777 860 ntTSL 56.14□□□□□ -1.436e-12■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 AC079781.5-203ENST00000641315 2059 nt18.57■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt18.2■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-202ENST00000394308 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-205ENST00000422745 1865 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.812e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.519e-11■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM38B-203ENST00000434214 502 ntTSL 210.34□□□□□ -0.759e-11■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 HS2ST1-203ENST00000591456 540 ntTSL 45.73□□□□□ -1.499e-11■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 LRP6-205ENST00000540527 593 ntTSL 510.31□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 LRP6-206ENST00000543091 4774 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 LRP6-203ENST00000538239 7812 ntTSL 1 (best)5.45□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.298e-8■■■■■ 33.9
IGF2BP1Q9NZI8 ASAH1-259ENST00000637792 581 ntTSL 48.62□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 33.8
IGF2BP1Q9NZI8 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 514.02□□□□□ -0.174e-9■■■■■ 33.8
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 33.7
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 33.7
IGF2BP1Q9NZI8 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.421e-7■■■■■ 33.7
IGF2BP1Q9NZI8 KANSL1-210ENST00000574963 1493 nt13.67□□□□□ -0.222e-9■■■■■ 33.7
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.364e-7■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-205ENST00000509143 562 ntTSL 24.67□□□□□ -1.666e-11■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CYFIP1-206ENST00000613006 544 ntTSL 413.15□□□□□ -0.37e-10■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CYFIP1-209ENST00000619037 575 ntTSL 413.03□□□□□ -0.327e-10■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CYFIP1-204ENST00000611832 582 ntTSL 212.55□□□□□ -0.47e-10■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.827e-10■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.017e-10■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 28.14□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 28□□□□□ -1.133e-9■■■■■ 33.6
IGF2BP1Q9NZI8 CCNY-209ENST00000493157 816 ntTSL 516.84■□□□□ 0.295e-7■■■■■ 33.5
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-213ENST00000503937 1564 ntTSL 1 (best)7.91□□□□□ -1.146e-8■■■■■ 33.5
IGF2BP1Q9NZI8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.053e-10■■■■■ 33.5
IGF2BP1Q9NZI8 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.089e-7■■■■■ 33.5
IGF2BP1Q9NZI8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 33.5
IGF2BP1Q9NZI8 PCBP2-209ENST00000547048 1696 ntTSL 26.45□□□□□ -1.382e-13■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.278e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.278e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA2-207ENST00000584026 561 ntTSL 46.57□□□□□ -1.368e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 RNF130-202ENST00000519708 598 ntTSL 26.28□□□□□ -1.48e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.48e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-201ENST00000265149 9588 ntTSL 55.72□□□□□ -1.498e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA2-203ENST00000579754 569 ntTSL 25.19□□□□□ -1.588e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.588e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.68e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 KPNA2-205ENST00000583269 611 ntTSL 44.95□□□□□ -1.628e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.868e-11■■■■■ 33.4
IGF2BP1Q9NZI8 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 210.02□□□□□ -0.818e-7■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.383e-17■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 EEF1E1-204ENST00000502429 591 ntTSL 38.56□□□□□ -1.043e-17■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.53e-17■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.523e-17■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-220ENST00000552055 521 ntTSL 58.34□□□□□ -1.077e-20■■■■■ 33.3
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-210ENST00000487370 494 ntTSL 320.33■□□□□ 0.855e-9■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-203ENST00000437587 818 ntTSL 519.36■□□□□ 0.695e-9■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-204ENST00000446692 662 ntTSL 413.21□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-206ENST00000456204 660 ntTSL 37.51□□□□□ -1.215e-9■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NIPSNAP2-209ENST00000472404 250 ntTSL 52.07□□□□□ -2.085e-9■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.227e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.337e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 OGFOD1-207ENST00000566157 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 OGFOD1-201ENST00000336111 2415 ntTSL 29.21□□□□□ -0.945e-11■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFS3-211ENST00000533507 1769 ntTSL 226.62■■□□□ 1.853e-8■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-8■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NDUFS3-202ENST00000524568 733 ntTSL 219.11■□□□□ 0.653e-8■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASIC4-205ENST00000474489 2403 ntTSL 1 (best)17.14■□□□□ 0.337e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.047e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.037e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUP214-207ENST00000476004 502 ntTSL 314.63□□□□□ -0.077e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUP188-208ENST00000491502 534 ntTSL 313.51□□□□□ -0.257e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUP214-219ENST00000528406 393 ntTSL 313.5□□□□□ -0.257e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUP188-205ENST00000477069 2941 ntTSL 1 (best)11.55□□□□□ -0.567e-10■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 WRN-203ENST00000521620 3593 ntTSL 1 (best)3.62□□□□□ -1.835e-19■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.855e-19■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.117e-8■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.447e-8■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZNF12-202ENST00000394917 662 ntTSL 324.28■■□□□ 1.482e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 33.2
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 59.77□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 33.1
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-202ENST00000414861 2534 ntTSL 1 (best)9.73□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 33.1
IGF2BP1Q9NZI8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.765e-7■■■■■ 33.1
IGF2BP1Q9NZI8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 33.1
IGF2BP1Q9NZI8 TMPO-212ENST00000556029 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 33.1
IGF2BP1Q9NZI8 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.058e-7■■■■■ 33.1
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 372.3 ms