Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMPD3Q9NY59 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMPD3Q9NY59 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SMPD3Q9NY59 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPD3Q9NY59 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms