Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXI6

RNF186, RING finger protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF186Q9NXI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RNF186Q9NXI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RNF186Q9NXI6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNF186Q9NXI6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNF186Q9NXI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNF186Q9NXI6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms