Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM100Q9NV29 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM100Q9NV29 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM100Q9NV29 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms