Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS91

RAD18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD18Q9NS91 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD18Q9NS91 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD18Q9NS91 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD18Q9NS91 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD18Q9NS91 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.6 ms