Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms