Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

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Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP13A2Q9NQ11 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP13A2Q9NQ11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP13A2Q9NQ11 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP13A2Q9NQ11 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
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