Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6AQ9NPB6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARD6AQ9NPB6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARD6AQ9NPB6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PARD6AQ9NPB6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms