Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM60AQ9NP50 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM60AQ9NP50 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM60AQ9NP50 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM60AQ9NP50 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM60AQ9NP50 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM60AQ9NP50 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM60AQ9NP50 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM60AQ9NP50 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms