Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBE2OQ9C0C9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
UBE2OQ9C0C9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UBE2OQ9C0C9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
UBE2OQ9C0C9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UBE2OQ9C0C9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms