Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SHANK3Q9BYB0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SHANK3Q9BYB0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SHANK3Q9BYB0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
SHANK3Q9BYB0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SHANK3Q9BYB0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SHANK3Q9BYB0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms