Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SSBP3Q9BWW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SSBP3Q9BWW4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SSBP3Q9BWW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSBP3Q9BWW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms