Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF3

RBM4, RNA-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4Q9BWF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RBM4Q9BWF3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM4Q9BWF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM4Q9BWF3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM4Q9BWF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms