Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
HIRIP3Q9BW71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HIRIP3Q9BW71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HIRIP3Q9BW71 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
HIRIP3Q9BW71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms