Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SDF4Q9BRK5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SDF4Q9BRK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SDF4Q9BRK5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms