Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHOXF2Q9BQY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RHOXF2Q9BQY4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RHOXF2Q9BQY4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RHOXF2Q9BQY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RHOXF2Q9BQY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RHOXF2Q9BQY4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms