Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ATP5SQ99766 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATP5SQ99766 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATP5SQ99766 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms