Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.83■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
LMTK3Q96Q04 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
LMTK3Q96Q04 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
LMTK3Q96Q04 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.69■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
LMTK3Q96Q04 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
LMTK3Q96Q04 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
LMTK3Q96Q04 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
LMTK3Q96Q04 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms