Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZIM3Q96PE6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZIM3Q96PE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZIM3Q96PE6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZIM3Q96PE6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIM3Q96PE6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms