Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AGAP4Q96P64 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP4Q96P64 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGAP4Q96P64 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGAP4Q96P64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGAP4Q96P64 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms