Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RUNDC3BQ96NL0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RUNDC3BQ96NL0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RUNDC3BQ96NL0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RUNDC3BQ96NL0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms