Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZNF558Q96NG5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZNF558Q96NG5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZNF558Q96NG5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF558Q96NG5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF558Q96NG5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms